個人事業主の会計ソフトおすすめ3選【初年度0円あり】確定申告まで費用で比較

結論：初年度の費用で見た早見表

個人事業主向けの最安プランを、初年度と2年目以降に分けて並べました。

🗓 価格確認日：やよいの青色申告・freeeは2026年9月4日、マネーフォワードは2026年7月31日に各公式サイトで確認（すべて税抜・年払い時）。変更の可能性があるため申込前に公式サイトでご確認ください。

2年目以降の年額はどれも1万円台前半で、実質的な差はほとんどありません。3社の違いが最も大きく出るのは初年度です。やよいの青色申告だけが1年間まるごと0円で、しかも機能制限なしに確定申告まで通せます。

なぜ「初年度の費用」で比べるのか

会計ソフトの比較記事は機能の多さで順位をつけることが多いのですが、個人事業主が最初に選ぶ場面では、機能差はほとんど判断材料になりません。3社とも青色申告65万円控除に必要な複式簿記・e-Tax提出に対応しており、最安プランでも確定申告は完結できるからです。

それより現実的な問題は、使ってみないと自分に合うか分からないのに、合わなかったときの乗り換えコストが高いことです。会計データは年度をまたいで蓄積されるため、途中で乗り換えると再入力や調整が発生します。

つまり、最初の1年をどれだけ低いリスクで試せるかが、実質的にいちばん重要な比較軸になります。この記事ではその観点で順位をつけています。

おすすめ3選

※ 本記事はアフィリエイトリンクを含みます。順位は初年度の費用を基準に付けており、価格・プランは記事確認時点の情報です。

3年間の総額で比べる

初年度だけ安くても、その後の支払いが高ければ意味がありません。3年使った場合の総額を計算しました。

🗓 すべて税抜・年払い時の金額です。やよいの青色申告は初年度無償キャンペーン適用時。2年目以降の価格改定やキャンペーン変更の可能性があるため、あくまで現時点での試算としてご覧ください。

3年間ではやよいの青色申告セルフが23,600円で最安、マネーフォワードとの差は8,800円です。ベーシックで始めた場合も、2年目にセルフへ変更すれば総額は23,600円のままになります。初年度はサポート付きで0円、2年目から最安プランへ、という組み合わせが費用面では最も合理的です。

インボイス登録者は最安プランでは足りない

見落とされやすいのですが、インボイス（適格請求書発行事業者）の登録をしている方は課税事業者なので、消費税の申告が必要です。そして各社とも、最安プランでは消費税申告に対応していない場合があります。

インボイス登録済みの方が3社を比べる場合、最安プランではなく消費税申告に対応したプランどうしで比較する必要があります。この場合、freeeとマネーフォワードの差は年間8,400円と大きく開きます。

タイプ別の選び方

迷った場合は、まずやよいの青色申告を初年度0円で始めるのが最もリスクが小さいと思います。1年間かけて実際に申告まで済ませたうえで、合わなければ2年目に乗り換えられるからです。逆にfreeeやマネーフォワードから始めると、1ヶ月の無料期間では判断材料が足りないまま有料契約に入ることになります。

選ぶときに見落としやすいポイント

よくある質問

まとめ

個人事業主向けの会計ソフトは、2年目以降の年額で見ると3社ほぼ横並びです。差が出るのは初年度で、やよいの青色申告 オンラインだけが1年間0円・機能制限なしで使えます。確定申告を1回通してから継続を判断できるのは、現状この選択肢だけです。

ただし絶対的な優劣があるわけではありません。簿記の知識がゼロならfreeeの質問形式が最も負担が軽く、スマホだけで完結させたい場合もfreee一択です。長く使う前提で毎年の支払いを最優先するならマネーフォワードが最安になります。

自分の条件を1つ決めてから選べば、迷う要素はほとんどありません。